公開征集意見已于7月28日結(jié)束。中國人大網(wǎng)顯示，在為期一個月的時間里，《草案》征集意見超過13萬條。其中，個稅起征點的設置、專項扣除的細則標準仍是公眾關(guān)注的焦點。
此次改革是個稅法第七次大修，起征點將由每月的3500元提至5000元。對此，不少觀點認為，起征點仍然偏低。在全國人大常委會對個稅草案一審時，部分委員就建議提高起征點至6000-10000元不等。2011年,個稅草案建議起征點提高至3000元，經(jīng)過聽取各方意見后，全國人大常委會最終將起征點提高至3500元。而在意見征求結(jié)束后，個稅起征點會否調(diào)整，備受外界關(guān)注。
同時，鑒于不同地區(qū)的收入差距以及家庭實際收入情況，還有意見提出，起征點的設定不必搞全國統(tǒng)一標準。十三屆全國人大常委會委員鮮鐵可表示，在全國范圍內(nèi)規(guī)定統(tǒng)一的免征額，難以充分反映各省份地區(qū)的實際消費支出情況，不利于實現(xiàn)稅負公平。
不過，業(yè)內(nèi)人士不贊同“按地區(qū)經(jīng)濟水平實施不同的個稅起征點”。他認為，跨行政區(qū)的時候最好不要有個稅的壁壘去影響（勞動力）要素流動的市場調(diào)節(jié)機制。在賈康看來，把個稅起征點設定成一個自動調(diào)節(jié)的機制和物價水平掛鉤，不失為一個可以考慮的趨向。如每3年根據(jù)物價指數(shù)自動調(diào)整。
除起征點外，《草案》提出的專項附加扣除也引發(fā)爭論?！恫莅浮凤@示，納稅額將扣除子女教育、繼續(xù)教育、大病醫(yī)療、住房貸款利息和住房租金等的支出，但沒有給出專項附加扣除的具體范圍、標準和實施步驟。有專家指出，若申報程序復雜，納稅人申報成本過高，可能使之流于形式。
而在扣除項目上，由于《草案》提出的多涉及已婚家庭，因此有人認為將“專項附加扣除”解讀為“單身稅”。對此，中國政法大學財稅法研究中心主任施正文表示，對于養(yǎng)育子女的家庭，因為負擔重，對產(chǎn)生的支出適當給予扣除，是合理和應當?shù)?。不過，施正文也提出，專項附加扣除考慮家庭因素只是第一步，未來還可以逐漸設置單身申報、夫妻聯(lián)合申報、夫妻單獨申報等多種申報單位，由納稅人根據(jù)自身情況選擇。
鮮鐵可曾在審議《草案》時表示，逐步過渡到按照家庭收入為單位納稅的方式才能全面體現(xiàn)稅收公平。應在充分考慮家庭整體負擔的前提下，對年度內(nèi)家庭成員所取得的全部收入綜合計稅。
然而建立以家庭為課稅單位的申報機制，相關(guān)部門還將面對許多挑戰(zhàn)。由于人們收入來源愈加多樣，且存在許多非貨幣支付，以及與稅務部門共享的個人征信系統(tǒng)尚未建立，稅務部門要完全準確掌握家庭收入難度還很大。
